MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 2751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015511	GCA	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661769
2	NC_015511	GA	3	6	683	688	50 %	0 %	50 %	0 %	332661769
3	NC_015511	G	6	6	780	785	0 %	0 %	100 %	0 %	332661769
4	NC_015511	CGG	2	6	943	948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661769
5	NC_015511	GGAT	2	8	998	1005	25 %	25 %	50 %	0 %	332661769
6	NC_015511	GAG	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661769
7	NC_015511	GGA	2	6	1046	1051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661769
8	NC_015511	TCC	2	6	1054	1059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661769
9	NC_015511	GGC	2	6	1104	1109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661769
10	NC_015511	ATTGC	2	10	1135	1144	20 %	40 %	20 %	20 %	332661769
11	NC_015511	GGAG	2	8	1473	1480	25 %	0 %	75 %	0 %	332661770
12	NC_015511	GAG	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661770
13	NC_015511	TGG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661770
14	NC_015511	ATG	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661770
15	NC_015511	TGC	2	6	1644	1649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661770
16	NC_015511	CGG	2	6	1731	1736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661770
17	NC_015511	TGC	3	9	1757	1765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661770
18	NC_015511	AGTTGC	2	12	1790	1801	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332661770
19	NC_015511	T	6	6	1824	1829	0 %	100 %	0 %	0 %	332661770
20	NC_015511	TGGA	2	8	1967	1974	25 %	25 %	50 %	0 %	332661770
21	NC_015511	GGCCT	2	10	2053	2062	0 %	20 %	40 %	40 %	332661770
22	NC_015511	CGG	2	6	2064	2069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661770
23	NC_015511	GGC	2	6	2110	2115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661770
24	NC_015511	GGT	2	6	2136	2141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661770
25	NC_015511	TCG	3	9	2150	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661770
26	NC_015511	GGC	3	9	2279	2287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661771
27	NC_015511	CGA	2	6	2291	2296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
28	NC_015511	GTT	2	6	2345	2350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661771
29	NC_015511	GTT	2	6	2385	2390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661771
30	NC_015511	CGATGC	2	12	2417	2428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332661771
31	NC_015511	CAG	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
32	NC_015511	GGT	2	6	2571	2576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661771
33	NC_015511	CCG	2	6	2669	2674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661771
34	NC_015511	CTC	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661771
35	NC_015511	CGA	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
36	NC_015511	GCA	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
37	NC_015511	GCC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661771
38	NC_015511	TGT	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661771
39	NC_015511	TGGA	2	8	2785	2792	25 %	25 %	50 %	0 %	332661771
40	NC_015511	GC	3	6	2830	2835	0 %	0 %	50 %	50 %	332661771
41	NC_015511	CGG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661771
42	NC_015511	A	6	6	2934	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	332661771
43	NC_015511	T	6	6	3074	3079	0 %	100 %	0 %	0 %	332661771
44	NC_015511	A	6	6	3085	3090	100 %	0 %	0 %	0 %	332661771
45	NC_015511	CAGC	2	8	3177	3184	25 %	0 %	25 %	50 %	332661771
46	NC_015511	CGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
47	NC_015511	ATTT	2	8	3251	3258	25 %	75 %	0 %	0 %	332661771
48	NC_015511	GGA	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661771
49	NC_015511	GCT	2	6	3555	3560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661771
50	NC_015511	TCC	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661771
51	NC_015511	GGA	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661771
52	NC_015511	GGT	2	6	4165	4170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661772
53	NC_015511	AGC	2	6	4241	4246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661772
54	NC_015511	TGG	2	6	4277	4282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661772
55	NC_015511	CGG	2	6	4310	4315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661772
56	NC_015511	TGA	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661772
57	NC_015511	TGG	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661772
58	NC_015511	GATC	2	8	4488	4495	25 %	25 %	25 %	25 %	332661772
59	NC_015511	GAG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661772
60	NC_015511	GCA	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661772
61	NC_015511	GTT	2	6	4669	4674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661772
62	NC_015511	TCA	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661772
63	NC_015511	A	6	6	4715	4720	100 %	0 %	0 %	0 %	332661772
64	NC_015511	T	6	6	4793	4798	0 %	100 %	0 %	0 %	332661772
65	NC_015511	GCA	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661772
66	NC_015511	A	6	6	4891	4896	100 %	0 %	0 %	0 %	332661772
67	NC_015511	GTT	2	6	4909	4914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661772
68	NC_015511	T	6	6	4972	4977	0 %	100 %	0 %	0 %	332661772
69	NC_015511	CAT	2	6	5029	5034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661772
70	NC_015511	TCC	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661772
71	NC_015511	GGCG	2	8	5125	5132	0 %	0 %	75 %	25 %	332661772
72	NC_015511	CAA	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661772
73	NC_015511	TCT	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661772
74	NC_015511	T	6	6	5208	5213	0 %	100 %	0 %	0 %	332661772
75	NC_015511	AAATT	2	10	5225	5234	60 %	40 %	0 %	0 %	332661772
76	NC_015511	TGC	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661772
77	NC_015511	GTTGA	2	10	5290	5299	20 %	40 %	40 %	0 %	332661772
78	NC_015511	TGC	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661772
79	NC_015511	GAG	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661772
80	NC_015511	A	6	6	5377	5382	100 %	0 %	0 %	0 %	332661772
81	NC_015511	CTC	2	6	5422	5427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661772
82	NC_015511	CAA	3	9	5536	5544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661772
83	NC_015511	GCGCA	2	10	5641	5650	20 %	0 %	40 %	40 %	332661772
84	NC_015511	GT	3	6	5676	5681	0 %	50 %	50 %	0 %	332661772
85	NC_015511	T	7	7	5727	5733	0 %	100 %	0 %	0 %	332661772
86	NC_015511	ACT	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661773
87	NC_015511	CAG	2	6	6104	6109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661773
88	NC_015511	A	6	6	6533	6538	100 %	0 %	0 %	0 %	332661774
89	NC_015511	GATG	2	8	6541	6548	25 %	25 %	50 %	0 %	332661774
90	NC_015511	T	8	8	6676	6683	0 %	100 %	0 %	0 %	332661775
91	NC_015511	CA	3	6	6738	6743	50 %	0 %	0 %	50 %	332661775
92	NC_015511	TGC	2	6	6745	6750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661775
93	NC_015511	ATA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661775
94	NC_015511	ACT	2	6	6986	6991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661775
95	NC_015511	CAG	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661775
96	NC_015511	CCT	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661775
97	NC_015511	TAC	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661775
98	NC_015511	CAT	2	6	7305	7310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661775
99	NC_015511	TCC	2	6	7321	7326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661775
100	NC_015511	CAAT	2	8	7412	7419	50 %	25 %	0 %	25 %	332661775
101	NC_015511	TAA	2	6	7586	7591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661775
102	NC_015511	CGA	2	6	8291	8296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661776
103	NC_015511	ATT	2	6	8317	8322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661776
104	NC_015511	ACC	2	6	8335	8340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661776
105	NC_015511	TAT	2	6	8408	8413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661776
106	NC_015511	GAA	2	6	8421	8426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661776
107	NC_015511	AGAAT	2	10	8430	8439	60 %	20 %	20 %	0 %	332661776
108	NC_015511	GTGA	2	8	8481	8488	25 %	25 %	50 %	0 %	332661776
109	NC_015511	AGA	2	6	8489	8494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661776
110	NC_015511	TTC	3	9	8586	8594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661777
111	NC_015511	AGG	2	6	8667	8672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661777
112	NC_015511	GA	3	6	8677	8682	50 %	0 %	50 %	0 %	332661777
113	NC_015511	GGC	2	6	8943	8948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661778
114	NC_015511	TGC	3	9	8953	8961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661778
115	NC_015511	TAA	2	6	9035	9040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661778
116	NC_015511	TTC	2	6	9103	9108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661778
117	NC_015511	AGG	2	6	9155	9160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661778
118	NC_015511	CGC	2	6	9169	9174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661778
119	NC_015511	G	6	6	9184	9189	0 %	0 %	100 %	0 %	332661778
120	NC_015511	GTA	2	6	9215	9220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661778
121	NC_015511	AACTCA	2	12	9251	9262	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332661778
122	NC_015511	GGC	2	6	9274	9279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661778
123	NC_015511	CATC	2	8	9300	9307	25 %	25 %	0 %	50 %	332661778
124	NC_015511	TCC	2	6	9367	9372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661778
125	NC_015511	CAA	2	6	9403	9408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661778
126	NC_015511	A	6	6	9437	9442	100 %	0 %	0 %	0 %	332661778
127	NC_015511	ATC	2	6	9488	9493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661778
128	NC_015511	TGC	2	6	9561	9566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661778
129	NC_015511	ATT	2	6	9780	9785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661779
130	NC_015511	A	7	7	9790	9796	100 %	0 %	0 %	0 %	332661779
131	NC_015511	CAG	2	6	9808	9813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661779
132	NC_015511	GGC	2	6	9919	9924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
133	NC_015511	AGGAG	2	10	9942	9951	40 %	0 %	60 %	0 %	332661779
134	NC_015511	CAG	2	6	9967	9972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661779
135	NC_015511	GCG	2	6	9980	9985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
136	NC_015511	GGC	2	6	10033	10038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
137	NC_015511	CGG	2	6	10046	10051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
138	NC_015511	GGC	2	6	10090	10095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
139	NC_015511	CTT	2	6	10111	10116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661779
140	NC_015511	GGT	2	6	10132	10137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661779
141	NC_015511	AGGCC	2	10	10179	10188	20 %	0 %	40 %	40 %	332661779
142	NC_015511	GAG	2	6	10240	10245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661779
143	NC_015511	GCGG	2	8	10252	10259	0 %	0 %	75 %	25 %	332661779
144	NC_015511	GGC	2	6	10282	10287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
145	NC_015511	GGA	2	6	10290	10295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661779
146	NC_015511	T	6	6	10339	10344	0 %	100 %	0 %	0 %	332661779
147	NC_015511	TGGGG	2	10	10361	10370	0 %	20 %	80 %	0 %	332661779
148	NC_015511	TCCC	2	8	10378	10385	0 %	25 %	0 %	75 %	332661779
149	NC_015511	GAAAG	2	10	10407	10416	60 %	0 %	40 %	0 %	332661779
150	NC_015511	TGA	2	6	10426	10431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661779
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152	NC_015511	A	6	6	10498	10503	100 %	0 %	0 %	0 %	332661779
153	NC_015511	CAG	2	6	10594	10599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661779
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155	NC_015511	TCAAAA	2	12	10657	10668	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332661780
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157	NC_015511	GTCGA	2	10	10779	10788	20 %	20 %	40 %	20 %	332661780
158	NC_015511	GCA	2	6	10794	10799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661780
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160	NC_015511	CGG	2	6	10877	10882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661780
161	NC_015511	TGT	3	9	11188	11196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661781
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164	NC_015511	ATC	2	6	11366	11371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
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168	NC_015511	T	7	7	11586	11592	0 %	100 %	0 %	0 %	332661781
169	NC_015511	TGTC	2	8	11624	11631	0 %	50 %	25 %	25 %	332661781
170	NC_015511	ATC	2	6	11692	11697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
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172	NC_015511	CCA	2	6	11793	11798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661781
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192	NC_015511	ACCGT	2	10	13070	13079	20 %	20 %	20 %	40 %	332661781
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240	NC_015511	TCTTTG	2	12	15392	15403	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332661781
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248	NC_015511	ATTAGT	2	12	15952	15963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332661782
249	NC_015511	GGTA	2	8	15974	15981	25 %	25 %	50 %	0 %	332661782
250	NC_015511	TAT	2	6	16014	16019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661782
251	NC_015511	CA	3	6	16061	16066	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
252	NC_015511	AACC	2	8	16117	16124	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
253	NC_015511	TCT	2	6	16161	16166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661782
254	NC_015511	GTA	2	6	16177	16182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661782
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256	NC_015511	AGCA	2	8	16223	16230	50 %	0 %	25 %	25 %	332661782
257	NC_015511	CAT	2	6	16266	16271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661782
258	NC_015511	AC	4	8	16435	16442	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
259	NC_015511	CAC	2	6	16485	16490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661782
260	NC_015511	ACT	2	6	16567	16572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661782
261	NC_015511	GTC	2	6	16642	16647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661782
262	NC_015511	AAT	2	6	16660	16665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661782
263	NC_015511	TTA	2	6	16667	16672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661782
264	NC_015511	CTT	2	6	16711	16716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661782
265	NC_015511	TTGTC	2	10	16890	16899	0 %	60 %	20 %	20 %	332661782
266	NC_015511	T	6	6	16919	16924	0 %	100 %	0 %	0 %	332661782
267	NC_015511	AC	3	6	16939	16944	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
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269	NC_015511	T	6	6	17045	17050	0 %	100 %	0 %	0 %	332661782
270	NC_015511	AC	3	6	17065	17070	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
271	NC_015511	AC	4	8	17317	17324	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
272	NC_015511	ATC	2	6	17401	17406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661782
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274	NC_015511	TAC	2	6	17574	17579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661782
275	NC_015511	CAG	2	6	17586	17591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661782
276	NC_015511	AAAT	2	8	17693	17700	75 %	25 %	0 %	0 %	332661782
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278	NC_015511	ATTG	2	8	17820	17827	25 %	50 %	25 %	0 %	332661782
279	NC_015511	AGC	2	6	17828	17833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661782
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282	NC_015511	A	6	6	18019	18024	100 %	0 %	0 %	0 %	332661782
283	NC_015511	GAGT	2	8	18078	18085	25 %	25 %	50 %	0 %	332661782
284	NC_015511	CCA	2	6	18090	18095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661782
285	NC_015511	GTT	2	6	18120	18125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661782
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292	NC_015511	A	6	6	18458	18463	100 %	0 %	0 %	0 %	332661782
293	NC_015511	CAT	2	6	18526	18531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661782
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295	NC_015511	TGA	2	6	18690	18695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661782
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313	NC_015511	T	6	6	19755	19760	0 %	100 %	0 %	0 %	332661782
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322	NC_015511	TTGA	2	8	20252	20259	25 %	50 %	25 %	0 %	332661783
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343	NC_015511	AC	3	6	21298	21303	50 %	0 %	0 %	50 %	332661784
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376	NC_015511	A	7	7	23407	23413	100 %	0 %	0 %	0 %	332661784
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386	NC_015511	CCA	2	6	23991	23996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661784
387	NC_015511	TGC	2	6	24015	24020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661784
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389	NC_015511	CAG	3	9	24090	24098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661784
390	NC_015511	GTA	2	6	24129	24134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661784
391	NC_015511	TAC	2	6	24169	24174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661784
392	NC_015511	CAG	3	9	24286	24294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661784
393	NC_015511	GGGTA	2	10	24373	24382	20 %	20 %	60 %	0 %	332661784
394	NC_015511	G	6	6	24402	24407	0 %	0 %	100 %	0 %	332661784
395	NC_015511	CGGT	2	8	24410	24417	0 %	25 %	50 %	25 %	332661784
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397	NC_015511	TCA	2	6	24470	24475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661784
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399	NC_015511	GGCT	2	8	24564	24571	0 %	25 %	50 %	25 %	332661784
400	NC_015511	TTC	2	6	24673	24678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661784
401	NC_015511	CAA	2	6	24694	24699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661784
402	NC_015511	CTT	2	6	24882	24887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661784
403	NC_015511	GAT	2	6	24925	24930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661784
404	NC_015511	CTT	2	6	25017	25022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661784
405	NC_015511	G	6	6	25032	25037	0 %	0 %	100 %	0 %	332661784
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418	NC_015511	ATG	3	9	26198	26206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661785
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423	NC_015511	T	8	8	26511	26518	0 %	100 %	0 %	0 %	332661785
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